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北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心簡介
發布時間:2014-12-16 13:24

 

01.簡介與研究方向

北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心(Beijing Engineering Technology Research Centre of Gene Sequencing and Gene Function Analysis)依托於北京市理化分析測試中心,聯合北京市計算中心、中國人民解放軍總醫院共同組成,20146月經北京市科學技術委員會認定,成為北京市的市級工程技術研究中心。

工程中心麵向首都生命科學、生物工程、生物醫藥、分子育種等領域的研究、開發和成果轉化需求,以基因測序和功能分析研發服務中的關鍵環節和共性技術為攻關目標,采用產學研聯合模式,重點開展高通量測序方法研究、基因數據庫的構建和分析挖掘、基因表達調控分析和分子診斷方法開發等研發工作,形成覆蓋基因層麵研究的鏈條式生物技術研發服務實體,推動國內外先進技術特別是在京科研機構相關成果的轉化和應用,通過模式和機製創新培養一支基因測序和功能分析技術團隊,為北京市生物產業發展提供有力的技術支撐。

作為中關村開放實驗室、首都科技條件平台成員單位和北科院重點實驗室,已經建立了一代和二代基因測序實驗室、分子生物學實驗室、臨床檢驗實驗室、高性能服務器機房等,總麵積超過5000平方米;中心還配備了Hiseq2500高通量基因測序儀、Miseq基因測序儀、3730XL型基因測序儀、3130XL型基因測序儀、ABI 7500fast型實時熒光定量PCR儀、熒光顯微鏡、倒置熒光顯微鏡、多功能酶標儀、化學發光檢測儀、高速冷離心機、超低溫冰箱、高性能計算機服務器等一大批高端儀器設備,價值超過5000萬元。部署了180多套生物學常用分析軟件,商業化專業分析軟件3套,NCBIDDJB7個國際開源生物信息數據庫實現了本地化,存貯了50種生物基因組數據庫。

 

 

02.研究進展與成果

技術一:開展法醫基因組學應用研究

現已建立成熟的二代測序技術平台,通過檢測 SNPSTR對降解檢材精細分型,同時開展了高分辨率HLA分型研究,開發混合樣本區分新方法。基於轉錄組技術,開發新的個體識別標記物。利用 DNA甲基化檢測技術,開展同卵雙胞胎鑒定工作。

技術二:分子診斷-基因檢測研究

使用一代測序、目標區域捕獲測序(NGS)、實時熒光定量PCRQPCR)、數字PCRddPCR)等檢測技術對疾病相關的致病基因、易感基因或藥物基因組學、基因組學進行檢測。檢測項目包括循環遊離DNA的腫瘤基因突變檢測,tp53基因全外顯子檢測、循環腫瘤DNA靶向用藥位點檢測(基因突變、拷貝數變異)、藥物基因組學檢測化療藥、靶向藥、cyp450個性化用藥檢測、21三體產前診斷、遺傳代謝性肝病分子診斷等。

技術三:生物分子互作計算機模擬及蛋白結構分析研究

開展生物分子之間作用機理研究以及藥物分子設計及藥物先導化合物優化相關研究,大大縮短生物分子的篩選優化時間,為生物分子作用機理及生物分子的藥物先導化合物的開發提供強力工具和服務保障。

技術四:微生物快速檢測技術在臨床中的應用

國產蛋白質質譜分析儀用於病原微生物鑒定,主要解決血流感染微生物經培養、分離等常規流程後對單菌落的自動化鑒定問題。

技術五:生物信息分析係統

自主研製的生物信息分析一體機在一台物理服務器上部署大量生物信息學分析軟件,分析流程和相關數據庫,可快速彈性滿足沒有生物信息分析背景的用戶在數據分析方麵的硬件和軟件要求,使研究人員避免繁瑣的軟件使用、程序編寫工作,能更多地關注科學問題的解決。

技術六:嗜酸性粒細胞與支氣管上皮細胞共調控過敏性氣道炎症反應機製及中藥單體葛根素的幹預研究

建立了嗜酸性粒細胞與支氣管上皮細胞接觸共培養實驗體係和大鼠哮喘實驗動物模型的實驗平台;利用流式細胞技術分析兩種細胞在接觸共培養過程中相互活化後細胞表麵炎性介質蛋白質表達的變化;葛根素是否通過抑製兩種細胞接觸後釋放的活性氧物質、抑製細胞內MAPKNF-KB等信號轉導通路的激活。

      

    

技術七:糖尿病、高血壓易感基因及藥物基因檢測Panel開發研究

對糖尿病、高血壓慢性疾病,針對更適合中國人群的易感基因位點和藥物基因位點在中國人群中驗證,建立基於二代測序的基因檢測panel,搭建了一鍵式分析流程,實時快速。

03.重點成果與獲獎

免疫層析檢測技術研究

開展以抗體抗原結合為基礎的免疫學快速檢測技術的研究與成果轉化工作。主要以免疫層析技術為基本形式,通過超順磁性微球,彩色乳膠微球,熒光微球等標記物進行研究,在食品安全和體外診斷領域進行應用。在醫學診斷領域開發出人絨毛膜促性腺激素,雌三醇,黃體生成素等指標。此外,本中心已與多家食品安全檢測企業、三甲醫院、科研院所進行委托研發,成果轉化等形式的合作工作。

 

食品安全檢測致病菌用免疫磁球的研發與應用

開展食品中致病菌檢測用納米免疫磁球的研發與應用工作,至今已研製出了針對腸埃希氏菌0157:H7、沙門氏菌、單增李斯特菌、金黃色葡萄球菌、誌賀氏菌五種典型致病菌檢測用納米免疫磁球,該磁球具有良好的穩定性、靈敏性與特異性,與國外產品相比,捕獲性能提高20%以上。該頂工作先後得到“北京市科技計劃”、“北京市優秀人才”、“ 北京市自然基金” 等頂目/課題的大力支持,發表SCI論文6篇,授權國家發明專利5頂。獲北京市超碰国产亚洲優秀科技成果獎1項,中國分析測試協會科學技術獎青年獎  1頂。

獲獎

■2014年度中國分析測試協會科學技術獎一等獎

血液學體液學試驗誤差根源研究與應用。軍隊醫院成果二等獎

教育信息化大賽一等獎

■2014年度中國分析測試協會科學技術獎青年獎

■2014年度北京市超碰国产亚洲優秀科技成果獎

      

  

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